長門はどのようにしてリンネガンを再覚醒させ、コントロールすることができたのでしょうか？

リンネガンは元々六道の賢者に属していた。彼はその力を二人の息子に分け、それが千住と内葉を形成した。人間がリンネガンを活性化するためには、ウチハと千住のDNAが必要だ。ウチハ・マダラは晩年、永遠のマンゲキョとハシラマの細胞（千住のDNA）を既に持っていたので、それを起動させることができたのです。

しかし問題は、長門はどうやって再起動させることができたのかということです。そう、幼い頃にリンネガンを移植したのはマダラだったのですが、目は移植されても、長門にはリンネガンを再活性化させるためのウチハのDNAも千住のDNAもありませんでした。どうしてそれが出来たのでしょうか？

そして、その続きとして、既に覚醒しているリンネガンを再覚醒させることが出来たとすると（元々はマダラが覚醒させていたのですが）、どうしてあんなに使いこなすことが出来たのでしょうか？彼は千住の遠い親戚であったかもしれないうずまき一族に属していましたが、今では賢者に例えられるマダラとは違い、SO6Pの特徴を何一つ持っていなかったので、どうやってうまくコントロールできたのかは正当化できません（DNAとリンネガンの両方を持っている）。彼はオビトからシェアリングガンを手に入れた。しかし、カカシはウチハではなかったので、使うたびに体に負担がかかり、チャクラを節約するために使わないときはシェアリングランをかぶせていました。後に修行を積んで得意になったとはいえ、やはり内葉ではないので、使いすぎた後に体に負担がかかっていた。同様に、長門は賢者の特性を持っていないので、彼の体はリンネガンをフルに起動させ、６つの痛みの道をコントロールすることができなかったはずです。